ซีซั่นที่ 5 เกิดขึ้น 18 เดือนหลังจากซีซั่นที่ 4 แจ็ค บาวเออร์ อดีตเจ้าหน้าที่หน่วยต่อต้านการก่อการร้ายเริ่มต้นซีซันนี้ โดยทำงานเป็นคนงานรายวันในโรงกลั่นน้ำมันภายใต้นามแฝง "แฟรงค์ ฟลินน์" ในเมืองโมฮาวี แคลิฟอร์เนีย ในวันสำคัญในการดำรงตำแหน่งประธานาธิบดีของชาร์ลส โลแกน สนธิสัญญาต่อต้านการก่อการร้ายกับประธานาธิบดียูริ ซูวารอฟ กำลังจะลงนามเมื่อเหตุการณ์พลิกผันอันน่าเศร้า
