Un terribile terremoto sconvolge la zona del Fuji e i movimenti tellurici riportano alla luce un fossile di un dinosauro gigante. In realtà il luogo era un nascondiglio-deposito di mostri iguana dell'Impero delle Tenebre. Venus e Boss intervengono sul luogo con la supervisione di Tetsuya che consiglia di eliminare il fossile, a causa di un brutto presentimento. Gli scienziati presenti si ribellano a questa scelta, ma il mostro presto viene fatto risvegliare dal Generale Drayato. Venus, assieme a Boss Robot, cerca di contenere il nemico mentre Tetsuya torna alla base per prendere il comando del Grande Mazinga. Ma il nemico bracca il giovane pilota che però riesce a raggiungere la fortezza e salire sul Grande Mazinga. Comincia lo scontro, ma arriva un secondo mostro che si unisce al primo, dando vita ad un terribile rettile robot. La lotta è tremenda ma alla fine è il bene a trionfare.
